El año es 2199. La alguna vez azul y verde Tierra ha sido reducida a un horrible y árido desierto radioactivo por los constates ataques del planeta Gamilas, lo cual obliga a los pocos sobrevivientes a ocultarse en el subsuelo. No obstante, el planeta Iscandar contacta a los humanos y envían los planos para construir una poderosa nave de guerra capaz de realizar el viaje a Iscandar y recoger un dispositivo para eliminar la radiación antes de que la humanidad desaparezca. El nombre de la nave: "El Crucero de Guerra Espacial Yamato"...