En esta temporada, Ash inicia su viaje en la región de Johto, encontrándose a Suicune, de la misma forma con la que vio a Ho-Oh al iniciar su viaje en la primera temporada. Al principio de su viaje conoce a una niña llamada Casey. El objetivo de Ash en esta temporada es ganar en la liga Johto y tiene su primer combate enCiudad Malva, donde Ash se enfrenta al primer líder de gimnasio, Pegaso. Al vencerlo con Charizard, Ash obtiene la Medalla Céfiro, que será la primera pero no la última medalla que obtenga.