Jormungand cuenta la historia de la joven traficante de armas Koko Hekmatyar, que se encarga de vender armas ilegalmente a escala internacional mientras intenta conseguir de su peculiar forma la paz mundial, y de su equipo altamente cualificado, formado principalmente por ex-militares veteranos y mercenarios, con el fin de evadir todos los controles y seguridad de diversas naciones durante la compra, transporte y entrega de su mercancía alrededor del mundo. La historia comienza con la incorporación al equipo de Koko de un joven y misterioso chico soldado llamado Jonah, inexpresivo y callado, que a pesar de odiar las armas sobre todas las cosas, es un completo experto en combate armado.