Sho Fukamachi, un joven normal, accidentalmente encuentra un objeto alienigena llamado Unidad (Unit), que cambiará su vida para siempre. La Unidad se une con Sho, resultando una poderosa forma de vida llamada Guyver. Con este gran poder, Sho combate con los misteriosos Chronos y Zoanoids, para proteger a sus amigos y al mundo. Sin saberlo, la pelea guiará al descubrimiento de los origenes de la raza humana, su destino, y sus Creadores...